Pada tahun 2013 Tokyo era moden, seorang salaryman (pekerja makan gaji) Jepun ateis yang tidak dinamakan, pada saat dibunuh oleh orang bawahan yang tidak berpuas hati kerana telah dipecat oleh prestasi yang buruk di tempat kerja. Salaryman itu berhadapan dengan entiti yang mengisytiharkan dirinya sebagai Tuhan yang mengutuk salaryman itu kerana tidak mempunyai 'iman'. Salaryman itu tidak percaya akan kewujudannya, mengkritik pelbagai kenyataannya dari perspektifnya sebagai seorang ateis dan secara mengejek menyebutnya sebagai 'Being X' (Kewujudan X). Entiti itu memutuskan untuk menjelmakan semula salaryman itu ke dunia di mana dia akan menghadapi keadaan yang cukup sukar untuk meminta bantuan kepada Being X.

Orang gaji itu dilahirkan semula sebagai Tanya Degurechaff, seorang gadis yatim piatu dalam realiti alternatif yang setara dengan Empayar Jerman, yang dikenali sebagai Empayar, di mana Perang Dunia I berlarutan hingga 1920-an. Menurut Being X, jika Tanya sama ada tidak mati secara semula jadi atau enggan mempercayainya, jiwanya akan meninggalkan kitaran penjelmaan semula dan akan dihantar ke neraka kerana banyak dosa yang telah dilakukan Tanya dalam kehidupan sebelumnya. Dalam mencari jalan keluar, Tanya memutuskan untuk menyertai Pasukan Sihir Empayar dan bertarung dalam peperangan, dengan harapan untuk mencapai pangkat yang cukup tinggi secepat mungkin untuk kekal jauh dari medan perang, dan dengan cara ini mengelakkan risiko terbunuh. Walaupun dia kini terpaksa bercakap dengan tubuh seorang gadis muda, Tanya tidak lama lagi bertukar menjadi seorang askar yang kejam yang mengutamakan kecekapan dan kerjayanya sendiri berbanding perkara lain, malah nyawa mereka yang berada di bawahnya, terutamanya mereka yang berpihak kepadanya.